R. Yosef Eliyahu Henkin has a responsum in which he addresses common errors relating to the placement of commas in prayer. The case in question here is one of the examples he mentions, and he states that it should be recited with the comma between "משולשת" and "בתורה" (i.e. position 1 in the question).
Shu"t Gevuros Eliyahu 1:15
א) דבר פלא ומכאיב הוא שדוקא קריעת שמע שהוא דאורייתא וקבלת עול מלכות
שמים הדרך הוא שכל כך חוטפים בזה עד שבלי ספק שאין זה בכלל קריאה לשום
מ"ד והיותר פלא שאפילו בשבת ויו"ט שמאריכין בתפלה הנה בקריאת שמע דוקא
חוטפים ובבתי החסידים מחלקים ברכת יוצר לפסקי פסקי וגם מזמרים הרבה בזה
[אגב לענ"ד יש בשירה ריקנית מבלי תיבות התפלה משום חשש הפסק בברכה ואין
ראיה מהגדולים שעשו כן שהם עשו מתוך התלהבות ורגש פנימי ובאופן זה הוא
בכלל קריאה ולא כן לדידן] ובהגיע לקריאת שמע חוטפים אותו כרגע ואי לדידי
צייתי היו מתקנים לקרוא קריאת שמע תמיד בבית הכנסת פסוקים פסוקים הש"ץ עם
הצבור וכל שכן בשבת ויו"ט ותמור זה לקצר בשאר דברים שאינם חיוביים ומקום
שאמרו להאריך דהיינו בקריאת שמע אינם רשאים לקצר
ב) וראיתי להעיר שמה שיש חזנים נוהגים לומר חתימת "גאל ישראל" בלחש הוא
שלא כדין כי תקמת חכמים שהש"ץ יתפלל בקול מיוצר עד אחר שמונה עשרה בכדי
להוציא את מי שאינו בקי ואפילו כשכולם בקיאים התקנה קיימת ואף שאצלנו
אומר הש"ץ רוב הברכות בלחש הוא משום שבדיעבד יוצאיםבקיצור של כל הברכה עם
מה שאומר סמוך לחתימה אבל על כל פנים הפתיחה של הברכה שפותחת בברוך
והחתימה ומעט מעין החתימה סמוך לה מחוייב לאמור בקול רם ועל כן גם תחילת
ברכת יוצר ומעריב ערבים צריך הש"ץ לאמר בקול רם [ומנהג הספרדים שהש"ץ
אומר בקול רם כל התפלה] וכן הוא מדינא דגמרא
ג) ואזכיר כאן מקומות בתפלה שהרבה משתבשים בסדורי התבות ואציין בזה הסדור
הנכון [ביוצר] "קדושה כולם כאחד עונים – ואומרים ביראה קדוש כו'" "לעומתם
משבחים – ואומרים ברוך כו'" "הודו והמליכו – ואמרו ה' ימלוך לעולם ועד"
"לך ענו שירה בשמחה רבה – ואמרו כולם מי כמוך כו'" "זה אלי ענו – ואמרו
ה' ימלוך כו'" "ימלוך ה' לעולם – אלהיך ציון לדור ודור"1
בקדושת שחרית דשבת "כי מחכים אנחנו לך מתי תמלוך – בציון בקרוב בימינו
לעולם ועד תשכון" בקדושת מוסף צריך הש"ץ בתחלה לומר בקול רם "ובדברי קדשך
כתוב לאמר" ואחר כך יאמר הקהל "ימלוך" "לדביר ביתך – ואשי ישראל ותפלתם"
[כן משמע מהמשך הלשון וגם מהתוס' (מנחות קי. ד"ה ומיכאל) והטור (סי' קכ)
לעיקר ונראה לי הפירוש דכשישב העבודה אז יקבל ברצון האשים עם התפלות]
בברכה המשולשת – בתורה הכתובה" [מצות ברכת כהנים תורה קרי לה"
As noted by Double AA, this was also printed in עדות לישראל.