Interestingly the Pitchei Tshuva on SA YD 89:1, in the context of eating meat after milk, brings an opinion from Beer Heitev shel Maharit that these could be shaot zemaniot. He quickly writes the Pri Megadim, Hokhmat Adam and Knesset Hagedolah disagree and the minhag is not to use shaot zemaniot.
עבה"ט של מהרי"ט ז"ל אם הם שעות זמניות. ועיין כו"פ ופמ"ג ובחכמת אדם
שהסכימו לדעת הכנה"ג דאינם זמניות ע"ש וכן המנהג.
The Pri Megadim brings the Knesset HaGedolah who writes (my translation - feel free to improve)
והני שש שעות הם חלק מכ"ד מעל"ע לא זמניות וכ"כ הכה"ג בהגהות הטור אות ו'
דוודאי אין לומר בימות החורף מתעכל מהר והוא פשוט:
The six hours are part of the 24 from time to time and are not shaot zemaniot and so wrote the Knesset HaGedola [...] that of course we cannot say that in the winter we digest faster and that is simple (obvious?)